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3月31日,清华大学生命学院孙前文实验室在《天然·植物》(Nature Plants)宣布了题为“H3K36甲基化符号的转录阻抗状况参加保持植物发育(H3K36 methylation stamps transcription resistive to preserve development in plants)”的研讨论文,该研讨发现一种全新概念的染色质状况——“转录阻抗”(Transcription Resistive)。与学界遍及认知的转录激活及转录缄默沉静现象不同,转录阻抗位点具有与转录激活区域相似的染色质环境,包含富集了RNA聚合酶II(Pol II),组蛋白润饰H3K36me3和高度敞开、松懈的染色质状况,但其转录水平与转录缄默沉静位点一起——简直检测不到重生转录本(nascent transcripts),归纳呈现出一种“反抗转录”的特征。
该研讨起始于剖析拟南芥中不同H3K36甲基转移酶催化H3K36甲基化的差异。研讨人员对不同的甲基转移酶突变体进行了H3K36me3的ChIP-seq剖析,并意外发现与野生型Col-0比较,突变体sdg8中编码基因上的H3K36me3水平明显添加(图1a)。随后依据突变体sdg8中H3K36me3水平的改变形式,研讨人员对编码基因进行了分类(分为C1-C4共四类,图1b和c),其间SDG8基因突变会导致C3类其他基因位点(约占总基因数的40%)表现出明显升高的H3K36me3水平,标明甲基转移酶SDG8存在按捺H3K36me3堆集的功用(图1b)。
真核生物基因组中的转录状况首要包含转录激活和缄默沉静。转录缄默沉静一般与基因组中的异染色质结构域相关,该区域往往富集了高水平的DNA甲基化和按捺性组蛋白润饰,并显示出高度紧凑的染色质状况,终究导致RN...
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